Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-DOAP06340 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DOAP06340 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms