Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms