Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EGFRP00533 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EGFRP00533 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EGFRP00533 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EGFRP00533 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EGFRP00533 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EGFRP00533 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EGFRP00533 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFRP00533 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFRP00533 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFRP00533 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFRP00533 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFRP00533 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFRP00533 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFRP00533 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EGFRP00533 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms