Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F13A1P00488 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F13A1P00488 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F13A1P00488 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
F13A1P00488 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F13A1P00488 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F13A1P00488 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F13A1P00488 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F13A1P00488 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F13A1P00488 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
F13A1P00488 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F13A1P00488 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
F13A1P00488 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F13A1P00488 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F13A1P00488 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
F13A1P00488 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
F13A1P00488 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
F13A1P00488 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F13A1P00488 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F13A1P00488 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F13A1P00488 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms