Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED1O96006 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZBED1O96006 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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