Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX58O95786 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX58O95786 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX58O95786 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX58O95786 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX58O95786 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX58O95786 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX58O95786 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX58O95786 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX58O95786 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms