Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCB11O95342 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCB11O95342 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms