Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOBTB3O94955 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBTB3O94955 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms