Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNKO75909 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNKO75909 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNKO75909 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNKO75909 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNKO75909 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNKO75909 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNKO75909 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNKO75909 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNKO75909 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNKO75909 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCNKO75909 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms