Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA3O75145 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA3O75145 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms