Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTSVO60911 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTSVO60911 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSVO60911 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSVO60911 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSVO60911 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSVO60911 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSVO60911 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSVO60911 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CTSVO60911 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms