Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KIAA0556O60303 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KIAA0556O60303 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KIAA0556O60303 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms