Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAK2O60296 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAK2O60296 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms