Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEFVO15553 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEFVO15553 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MEFVO15553 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEFVO15553 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEFVO15553 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEFVO15553 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEFVO15553 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEFVO15553 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEFVO15553 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEFVO15553 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms