Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KDM6AO15550 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM6AO15550 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms