Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYNJ2O15056 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms