Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3EO15041 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3EO15041 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms