Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD8O14715 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms