Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLRMTO00411 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms