Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
E9PCH4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
E9PCH4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
E9PCH4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
E9PCH4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
E9PCH4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
E9PCH4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
E9PCH4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
E9PCH4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E9PCH4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
E9PCH4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E9PCH4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
E9PCH4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
E9PCH4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
E9PCH4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
E9PCH4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
E9PCH4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
E9PCH4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
E9PCH4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
E9PCH4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
E9PCH4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
E9PCH4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
E9PCH4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
E9PCH4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E9PCH4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms