Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC85CA6NKD9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85CA6NKD9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms