Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A6NJR5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A6NJR5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A6NJR5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A6NJR5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A6NJR5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A6NJR5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A6NJR5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A6NJR5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms