Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GOLGA6L4A6NEF3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6L4A6NEF3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms