Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6BA6NDN3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms