Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6CA6NDK9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms