Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00862A6NCI5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms