Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XIRP2A4UGR9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
XIRP2A4UGR9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms