Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms