Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMX2A2RU54 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMX2A2RU54 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms