Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCE3A1L190 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCE3A1L190 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms