Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL2-SNX15V9GYD0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms