Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NCOA3Q9Y6Q9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCOA3Q9Y6Q9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms