Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB2Q9Y5E7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms