Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RAD54L2Q9Y4B4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAD54L2Q9Y4B4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAD54L2Q9Y4B4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms