Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDD3Q9Y3P4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDD3Q9Y3P4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms