Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC1Q9Y3B2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms