Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2J1Q9Y385 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms