Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BTRCQ9Y297 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BTRCQ9Y297 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BTRCQ9Y297 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BTRCQ9Y297 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BTRCQ9Y297 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms