Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GINS2Q9Y248 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms