Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GNEQ9Y223 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms