Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGTPBP1Q9UPW5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms