Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS3Q9UPU3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORCS3Q9UPU3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms