Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1RE1Q9UN81 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms