Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRNDQ9UKY0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRNDQ9UKY0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRNDQ9UKY0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRNDQ9UKY0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms