Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGA2Q9UJY4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GGA2Q9UJY4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms