Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSKSQ9UJT2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSKSQ9UJT2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSKSQ9UJT2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSKSQ9UJT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSKSQ9UJT2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSKSQ9UJT2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms