Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIX4Q9UIU6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX4Q9UIU6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms