Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYTH4Q9UIA0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms