Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCN11AQ9UI33 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms