Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC17A6Q9P2U8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC17A6Q9P2U8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms